أمراض الجهاز الهضمي هو اسم القسم الذي يفحص أمراض المريء والمعدة والأمعاء الدقيقة والغليظة. الأعضاء الأخرى التي يتعامل معها قسم أمراض الجهاز الهضمي هي الكبد والطحال والمرارة والبنكرياس. أثناء تشخيص أمراض هذه الأعضاء ، يتم تطبيق إجراءات مثل التنظير الداخلي وتنظير القولون و ercp والموجات فوق الصوتية. في تشخيص وعلاج حصوات وسرطانات القناة الصفراوية ، يتم تشخيصها وعلاجها بجهاز تنظير خاص يسمى التنظير الجانبي.