Gastroenterologija je naziv odjeljenja koje proučava bolesti jednjaka, želuca, tankog i debelog crijeva. Ostali organi kojima se bavi gastroenterološko odjeljenje su jetra, slezina, žučni mjehur i gušterača. Dok se dijagnosticiraju bolesti ovih organa, primjenjuju se postupci poput endoskopije, kolonoskopije, ercp i ultrazvuka. U dijagnostici i liječenju kamenaca i karcinoma bilijarnog trakta, dijagnosticira se i liječi posebnim endoskopskim uređajem koji se naziva bood дуodenoskopija.